MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-39

Total Repeats: 894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020381	ATG	2	6	5	10	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020381	AAG	2	6	11	16	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020381	GTA	2	6	51	56	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020381	AGA	3	9	188	196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020381	GAT	2	6	219	224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020381	CAT	3	9	277	285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020381	GATT	2	8	423	430	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020381	GAA	2	6	523	528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020381	CTT	2	6	547	552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020381	T	6	6	627	632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020381	TA	3	6	677	682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020381	TCA	2	6	741	746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020381	ATC	2	6	761	766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020381	ATG	2	6	776	781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020381	ATA	2	6	851	856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020381	TCA	3	9	876	884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020381	ATTCA	2	10	959	968	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_020381	TCG	2	6	1009	1014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020381	TAA	2	6	1034	1039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020381	GTT	2	6	1117	1122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020381	CTT	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_020381	TAA	2	6	1231	1236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020381	TCT	2	6	1246	1251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020381	T	6	6	1259	1264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020381	TGCT	2	8	1271	1278	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_020381	T	6	6	1295	1300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020381	TTTG	2	8	1305	1312	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020381	TCA	2	6	1318	1323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020381	T	6	6	1516	1521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020381	GTA	2	6	1675	1680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020381	TTG	2	6	1703	1708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020381	CATA	2	8	1738	1745	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_020381	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020381	TAT	2	6	1807	1812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020381	TTG	2	6	1826	1831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020381	TAA	2	6	1844	1849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020381	AGA	2	6	1865	1870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020381	TTC	2	6	1952	1957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_020381	CCAG	2	8	2030	2037	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_020381	ATTTT	2	10	2253	2262	20 %	80 %	0 %	0 %	452202138
41	NC_020381	T	6	6	2259	2264	0 %	100 %	0 %	0 %	452202138
42	NC_020381	AGT	2	6	2292	2297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202138
43	NC_020381	AGA	2	6	2374	2379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202138
44	NC_020381	TAA	2	6	2401	2406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202138
45	NC_020381	GAC	2	6	2435	2440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202138
46	NC_020381	TAA	2	6	2470	2475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202138
47	NC_020381	CTGTA	2	10	2497	2506	20 %	40 %	20 %	20 %	452202138
48	NC_020381	TCGA	2	8	2513	2520	25 %	25 %	25 %	25 %	452202138
49	NC_020381	GTT	2	6	2572	2577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202138
50	NC_020381	CCT	2	6	2580	2585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452202138
51	NC_020381	AAT	2	6	2597	2602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202138
52	NC_020381	TCAT	2	8	2628	2635	25 %	50 %	0 %	25 %	452202138
53	NC_020381	GATA	2	8	2639	2646	50 %	25 %	25 %	0 %	452202138
54	NC_020381	TTA	2	6	2709	2714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202138
55	NC_020381	AC	3	6	2722	2727	50 %	0 %	0 %	50 %	452202138
56	NC_020381	T	6	6	2739	2744	0 %	100 %	0 %	0 %	452202138
57	NC_020381	CAA	2	6	2755	2760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202138
58	NC_020381	TTG	2	6	2825	2830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202138
59	NC_020381	CTA	2	6	2871	2876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202138
60	NC_020381	TAAGA	2	10	3061	3070	60 %	20 %	20 %	0 %	452202138
61	NC_020381	TCC	2	6	3101	3106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_020381	TATT	2	8	3136	3143	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020381	ATTTAT	2	12	3176	3187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020381	ACA	2	6	3201	3206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020381	TGT	2	6	3219	3224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202139
66	NC_020381	ATT	2	6	3225	3230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202139
67	NC_020381	T	6	6	3229	3234	0 %	100 %	0 %	0 %	452202139
68	NC_020381	A	7	7	3239	3245	100 %	0 %	0 %	0 %	452202139
69	NC_020381	AAT	2	6	3265	3270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202139
70	NC_020381	AT	3	6	3272	3277	50 %	50 %	0 %	0 %	452202139
71	NC_020381	T	6	6	3285	3290	0 %	100 %	0 %	0 %	452202139
72	NC_020381	T	7	7	3313	3319	0 %	100 %	0 %	0 %	452202139
73	NC_020381	TGT	2	6	3349	3354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202139
74	NC_020381	T	6	6	3362	3367	0 %	100 %	0 %	0 %	452202139
75	NC_020381	TTC	2	6	3370	3375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202139
76	NC_020381	AT	3	6	3376	3381	50 %	50 %	0 %	0 %	452202139
77	NC_020381	CT	3	6	3394	3399	0 %	50 %	0 %	50 %	452202139
78	NC_020381	TA	3	6	3502	3507	50 %	50 %	0 %	0 %	452202140
79	NC_020381	GCC	2	6	3611	3616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452202140
80	NC_020381	AAAAT	2	10	3660	3669	80 %	20 %	0 %	0 %	452202140
81	NC_020381	CAA	2	6	3691	3696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202140
82	NC_020381	TCT	2	6	3816	3821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202140
83	NC_020381	ATC	2	6	3857	3862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202140
84	NC_020381	T	6	6	3864	3869	0 %	100 %	0 %	0 %	452202140
85	NC_020381	TAA	3	9	3889	3897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202140
86	NC_020381	CAT	2	6	3907	3912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202140
87	NC_020381	CAAAAT	2	12	3922	3933	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	452202140
88	NC_020381	TAC	2	6	3964	3969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202140
89	NC_020381	CTA	2	6	4072	4077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202140
90	NC_020381	TTC	2	6	4118	4123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202140
91	NC_020381	AAC	2	6	4124	4129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202140
92	NC_020381	CTT	2	6	4210	4215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202140
93	NC_020381	T	6	6	4222	4227	0 %	100 %	0 %	0 %	452202140
94	NC_020381	TTAG	2	8	4247	4254	25 %	50 %	25 %	0 %	452202141
95	NC_020381	T	6	6	4255	4260	0 %	100 %	0 %	0 %	452202141
96	NC_020381	GTT	2	6	4315	4320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202141
97	NC_020381	T	6	6	4333	4338	0 %	100 %	0 %	0 %	452202141
98	NC_020381	ACC	2	6	4421	4426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202141
99	NC_020381	CTT	2	6	4462	4467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202141
100	NC_020381	CTA	2	6	4474	4479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202141
101	NC_020381	TGA	2	6	4484	4489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202141
102	NC_020381	TTA	2	6	4524	4529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202141
103	NC_020381	T	6	6	4596	4601	0 %	100 %	0 %	0 %	452202141
104	NC_020381	TA	3	6	4699	4704	50 %	50 %	0 %	0 %	452202142
105	NC_020381	CTT	2	6	4739	4744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202142
106	NC_020381	TTTC	2	8	4754	4761	0 %	75 %	0 %	25 %	452202142
107	NC_020381	CTA	2	6	4813	4818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202142
108	NC_020381	TTC	2	6	4860	4865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202142
109	NC_020381	GTT	2	6	4909	4914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202142
110	NC_020381	CTAT	2	8	4924	4931	25 %	50 %	0 %	25 %	452202142
111	NC_020381	TCA	2	6	4985	4990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202142
112	NC_020381	TTG	2	6	5049	5054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202142
113	NC_020381	TA	3	6	5058	5063	50 %	50 %	0 %	0 %	452202142
114	NC_020381	AATTT	2	10	5092	5101	40 %	60 %	0 %	0 %	452202142
115	NC_020381	CTT	2	6	5114	5119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202142
116	NC_020381	AAC	2	6	5136	5141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202142
117	NC_020381	CTT	2	6	5153	5158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202142
118	NC_020381	TTC	2	6	5232	5237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202142
119	NC_020381	TTA	2	6	5290	5295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202142
120	NC_020381	CTGT	2	8	5317	5324	0 %	50 %	25 %	25 %	452202142
121	NC_020381	TC	3	6	5337	5342	0 %	50 %	0 %	50 %	452202142
122	NC_020381	CCT	2	6	5406	5411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452202143
123	NC_020381	TAA	2	6	5427	5432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202143
124	NC_020381	GAA	2	6	5469	5474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202143
125	NC_020381	ATAA	2	8	5481	5488	75 %	25 %	0 %	0 %	452202143
126	NC_020381	TTG	2	6	5524	5529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202143
127	NC_020381	ATT	2	6	5615	5620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020381	TTA	2	6	5625	5630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020381	TAAC	2	8	5638	5645	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_020381	AAAC	2	8	5672	5679	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_020381	AGT	2	6	5731	5736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020381	TAT	2	6	5775	5780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020381	TTAG	2	8	5785	5792	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020381	TAAC	2	8	5806	5813	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_020381	AGA	3	9	5919	5927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202144
136	NC_020381	A	7	7	5962	5968	100 %	0 %	0 %	0 %	452202144
137	NC_020381	ATT	2	6	6005	6010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202144
138	NC_020381	T	6	6	6027	6032	0 %	100 %	0 %	0 %	452202144
139	NC_020381	GAA	2	6	6038	6043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202144
140	NC_020381	A	6	6	6100	6105	100 %	0 %	0 %	0 %	452202144
141	NC_020381	GAA	2	6	6187	6192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202144
142	NC_020381	ATAA	2	8	6247	6254	75 %	25 %	0 %	0 %	452202144
143	NC_020381	GGGA	2	8	6300	6307	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020381	TAC	2	6	6321	6326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202145
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147	NC_020381	T	6	6	6409	6414	0 %	100 %	0 %	0 %	452202145
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150	NC_020381	ATTT	2	8	6622	6629	25 %	75 %	0 %	0 %	452202145
151	NC_020381	ATT	2	6	6638	6643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202145
152	NC_020381	GCAT	2	8	6662	6669	25 %	25 %	25 %	25 %	452202145
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158	NC_020381	ACAT	2	8	6808	6815	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
159	NC_020381	AAT	2	6	6943	6948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202146
160	NC_020381	A	6	6	7038	7043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_020381	AATATA	2	12	7077	7088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_020381	AATT	2	8	7093	7100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_020381	CTA	2	6	7124	7129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_020381	AG	3	6	7137	7142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
165	NC_020381	AC	3	6	7211	7216	50 %	0 %	0 %	50 %	452202147
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180	NC_020381	TAAG	2	8	7752	7759	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
181	NC_020381	ATT	2	6	7828	7833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_020381	GAA	2	6	7857	7862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
183	NC_020381	TCTTT	2	10	7880	7889	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
184	NC_020381	T	6	6	7887	7892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_020381	ATT	2	6	7896	7901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_020381	TATGA	2	10	7905	7914	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
187	NC_020381	ATAAA	2	10	7942	7951	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_020381	AGA	2	6	7952	7957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
189	NC_020381	GGT	2	6	7995	8000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_020381	TTCA	2	8	10514	10521	25 %	50 %	0 %	25 %	452202152
260	NC_020381	AC	3	6	10535	10540	50 %	0 %	0 %	50 %	452202152
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273	NC_020381	AGAA	2	8	11046	11053	75 %	0 %	25 %	0 %	452202153
274	NC_020381	TA	3	6	11066	11071	50 %	50 %	0 %	0 %	452202153
275	NC_020381	GA	3	6	11151	11156	50 %	0 %	50 %	0 %	452202153
276	NC_020381	AGA	2	6	11203	11208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202153
277	NC_020381	TAAA	2	8	11248	11255	75 %	25 %	0 %	0 %	452202153
278	NC_020381	TAG	2	6	11266	11271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
279	NC_020381	AACT	2	8	11293	11300	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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401	NC_020381	T	6	6	15833	15838	0 %	100 %	0 %	0 %	452202163
402	NC_020381	CTT	2	6	15847	15852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202163
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409	NC_020381	TTTA	2	8	16268	16275	25 %	75 %	0 %	0 %	452202163
410	NC_020381	TTC	2	6	16280	16285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202163
411	NC_020381	CCTT	2	8	16362	16369	0 %	50 %	0 %	50 %	452202163
412	NC_020381	GTT	2	6	16380	16385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202163
413	NC_020381	TA	3	6	16397	16402	50 %	50 %	0 %	0 %	452202163
414	NC_020381	AGGGG	2	10	16411	16420	20 %	0 %	80 %	0 %	452202163
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451	NC_020381	AAT	2	6	17966	17971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202165
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453	NC_020381	GA	3	6	18070	18075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_020381	TA	3	6	18524	18529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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